/ Forside / Karriere / Uddannelse / Højere uddannelser / Nyhedsindlæg
Login
Glemt dit kodeord?
Brugernavn

Kodeord


Reklame
Top 10 brugere
Højere uddannelser
#NavnPoint
Nordsted1 1588
erling_l 1224
ans 1150
dova 895
gert_h 800
molokyle 661
berpox 610
creamygirl 610
3773 570
10  jomfruane 570
Genetiske kode varianter
Fra : Jesus-loves-you


Dato : 21-01-05 20:45

"Jacob Andersen" skrev

Date: 20. november 2004 CET 03:10
Subject: Re: Intelligent design ryster darwinismen
news:419ea7c3$0$33742$14726298@news.sunsite.dk
>
> "Jesus-loves-you" <John15.13@Heaven> skrev i en meddelelse
> news:GJ6nd.65756$Vf.3296323@news000.worldonline.dk

file 3268

> > ... Har du et simuleringsprogram, der kan give en naturlig forklaring
> > på, at der
> > kun findes ét DNA-kodesprog for samtlige levende biologiske celler ?
> >
> > (matematisk set ville jeg - udfra en neutral synsvinkel - forvente et
> > hav af varianter) ...
>
> Faktisk er den genetiske kode også gradvist blevet tilpasset. Dette
> fremgår
> blandt andet af det faktum, at to codons i mitochondriel DNA bliver
> translateret til andre aminosyrer (grundet i egenskaberne for deres tRNA)
> end normalt. Således translateres AUA til methionin i mitochondrier
> (normalt
> isoleucin) og UGA til tryptophan (normalt stop-codon)*. Jævnfør
> endosymbioseteorien er det efterhånden en del år siden, mitochondrierne
> blev
> optaget og den eukaryote celle opstod - så denne diskrepans må kunne
> henføres til denne tid.
>
> Den sidste afvigelse (UGA-> tryptophan istedet for stop) gør sig forøvrigt
> også gældende for gærceller. Andre afvigelser fra den universelle kode kan
> ses i genomet for visse protozoer*.
>
> Ligesom musefælden blev cellernes proteinsyntetiske apparet heller ikke
> opfundet overnight. Vi ser dog kun ganske få mellemstadier der stadig
> fungerer i dag. Således må man populært formuleret sige, at der gennem
> tiden er blevet fundet en vinder - ganske i evolutionens ånd!
>
> Mvh
> Jacob Andersen
>
> * Kilde: Griffiths et al.: An Introduction to Genetic Analysis, Freeman,
> 7th Edition


Jeg har nu midlertidigt anskaffet mig bogen, både version 7 og 8, for
øvrigt en interessant lærebog ...

I kapittel 21 Extranuclear Genes (på side 627) gives genkoden for den humane
metochondrion, og det er fuldstændig korrekt, at vi har at gøre med en lille
*genkode-variant*, se indscanningsbilled ...

Date: 21. januar 2005 CET 20:42
Subject: Genkode-varianter
Newsgroup: dk.binaer
3583 news:dYcId.84521$Vf.3754826@news000.worldonline.dk

og jeg må ærlig tilstå, at jeg er ganske forbløffet.


Ændringerne er mere omfattende end du har beskrevet. Disse er følgende:

AUU ændret fra isoleucin til methionin
AUA ændret fra isoleucin til methionin
AUG ændret fra methionin til isoleucin
UGA ændret fra STOP til tryptophan
AGA ændret fra arginin til STOP
AGG ændret fra arginin til STOP

Er dette forstået (af mig) korrekt ?
(skemaet kan give anledning til misforståelser, hvilket *IKKE* gør bogen
100% pålidelig)

Der er navnlig en (for mig ny) *altafgørende* ændring i genkoden:

Varianten vil IKKE kunne fungere, dersom methionin indgår som en *nødvendig*
"byggeklods" i stofskifteprocessen, ved mindre at *samtlige* dertil hørende
DNA-koder ændres.

Årsagen hertil skyldes, at der kun findes én genkode for methionin (DNA-code
TAC, m-RNA AUG). Og denne er jo blevet ændret!

-

Dét, der nu bliver det interessante, er at undersøge, om dette i *praktis*
har nogen betydning:

1.
Om metochondriernes vital-funktioner er præget af ændringen ?

2.
Om *alle* eukaryoters mitochondrie-genkode er af denne varianttype ?


Hermed kan det fastslås *hvornår* ændringen er sket, og dermed give os et
svar på, om livets opståen er sket *en* gang, eller om der er tale om flere
úafhængige livsformers opståen.

Meget tyder dog på, at der er tale om en en *fælles* oprindelse, idet
genkodevarianterne er næsten identiske.

-

Mht. ...
> Den sidste afvigelse (UGA-> tryptophan istedet for stop) gør sig forøvrigt
> også gældende for gærceller. Andre afvigelser fra den universelle kode kan
> ses i genomet for visse protozoer*.

.... kan jeg IKKE úmiddelbart finde det sted, du henviser til, idet jeg
desværre ikke er så god til engelsk, så ...

Kunne du oplyse mig om sidetallet ?


Med venlig hilsen,
Mogens Kall, The servant of Michael
--
SETI: Win (vind) 3500 Danish Kr. (around 600 US $), jump ...
3493 news:UIMxd.76610$Vf.3624746@news000.worldonline.dk
(use perhaps http://www.google.dk/grphp )
File-number: 3584



 
 
Jesus-loves-you (23-01-2005)
Kommentar
Fra : Jesus-loves-you


Dato : 23-01-05 17:19

"Jesus-loves-you" skrev
news:gZcId.84522$Vf.3754830@news000.worldonline.dk

[ ... ]
> Dét, der nu bliver det interessante, er at undersøge, om dette i *praktis*
> har nogen betydning:
>
> 1.
> Om metochondriernes vital-funktioner er præget af ændringen ?
>
> 2.
> Om *alle* eukaryoters mitochondrie-genkode er af denne varianttype ?


Der er flere varianter:

=== citat start ===

Table 21-4

Comparison of the Universal Nuclear DNA Code
with Several Mitochondrial Codes
for Five Triplets in Which They Differ

Triplet code
________________________
TGA ATA AGA AGG AAA
_________________________________________
Nuclear Stop Ile Arg Arg Lys
Mitochondrial
Mammalia Trp Met Stop Stop Lys
Aves Trp Met Stop Stop Lys
Amphibia Trp Met Stop Stop Lys
Echinoderms Trp Ile Ser Ser Asn
Insecta Trp Met Ser Stop Lys
Nematodes Trp Met Ser Ser Lys
Platyhelminth Trp Met Ser Ser Asn
Cnidaria Trp Ile Arg Arg Lys

=== citat slut ====

Kilde:
Introduction to genetic analysis, 8. Edition
Anthony Griffiths, Susan Wessler,Richard Lewontin, William Gelbart, Suzuki,
Miller.
W. H. Freeman and Company, New York (2005)
Chapter 21, Evolutionary Genetics, 21.6 Origin of new genes, side 693
ISBN 0-7167-4939-4
EAN 9780716749394
www.whfreeman.com

se evt. indscanningsbillede på ...

Date: 23. januar 2005 CET 13:20
Subject: Re: Genkode-varianter
Newsgroup: dk.binaer
3588 news:aFMId.84789$Vf.3759091@news000.worldonline.dk

-

*Alle* varianterne har det til fælles, at stop-koden i TGA (DNA ACT, m-RNA
UGA) er blevet ændret til tryptofan. Det må derfor være sket *samtidig*,
dene ændring INDEN yderligere ændringer er kommet til.

Herefter kunne man umiddelbart forledes til at tro, at udviklingen
*forgrener* sig, således som man traditionelt beskriver et stamtræ, men ...
arh ... det skal ses:

M-a-a Met Stop Stop -
Insecta Met Ser Stop -
Nematodes Met Ser Ser -
Platyhelminth Met Ser Ser Asn
Echinoderms - Ser Ser Asn

.... de har ligesom "arven" noget fra hinanden *efter* differentieringen, og
det er jo i grunden ret úlogisk.

Det er ret usandsynligt, at en ændring ændres *tilbage* til udgangspunktet
igen.

Og det er også ret usandsynligt, at alle eventuelle mellemled skulle være
uddøde.


Med venlig hilsen,
Mogens Kall, The servant of Michael
--
SETI: Win (vind) 3500 Danish Kr. (around 600 US $), jump ...
3493 news:UIMxd.76610$Vf.3624746@news000.worldonline.dk
(use perhaps http://www.google.dk/grphp )
File-number: 3590



Jesus-loves-you (04-02-2005)
Kommentar
Fra : Jesus-loves-you


Dato : 04-02-05 14:30

"Jesus-loves-you" skrev

Date: 23. januar 2005 CET 17:19
3590 news:rbQId.84864$Vf.3759555@news000.worldonline.dk

[ ... ]

> Der er flere varianter:
>
> === citat start ===
>
> Table 21-4
>
> Comparison of the Universal Nuclear DNA Code
> with Several Mitochondrial Codes
> for Five Triplets in Which They Differ
>
> Triplet code
> ________________________
> TGA ATA AGA AGG AAA
> _________________________________________
> Nuclear Stop Ile Arg Arg Lys
> Mitochondrial
> Mammalia Trp Met Stop Stop Lys
> Aves Trp Met Stop Stop Lys
> Amphibia Trp Met Stop Stop Lys
> Echinoderms Trp Ile Ser Ser Asn
> Insecta Trp Met Ser Stop Lys
> Nematodes Trp Met Ser Ser Lys
> Platyhelminth Trp Met Ser Ser Asn
> Cnidaria Trp Ile Arg Arg Lys
>
> === citat slut ====
>
> Kilde:
> Introduction to genetic analysis, 8. Edition
> Anthony Griffiths, Susan Wessler,Richard Lewontin, William Gelbart,
> Suzuki, Miller.
> W. H. Freeman and Company, New York (2005)
> Chapter 21, Evolutionary Genetics, 21.6 Origin of new genes, side 693
> ISBN 0-7167-4939-4
> EAN 9780716749394
> www.whfreeman.com
>
> se evt. indscanningsbillede på ...
>
> Date: 23. januar 2005 CET 13:20
> Subject: Re: Genkode-varianter
> Newsgroup: dk.binaer
> 3588 news:aFMId.84789$Vf.3759091@news000.worldonline.dk


Øh ... jeg har været noget bælgøjet. Faktisk er varianterne allerede oplyst
i forrige udgave:

Introduction to genetic analysis, 7. Edition
Anthony J.F. Griffiths, Jeffrey H. Miller, David T. Suzuki,
Richard C. Lewontin, William H. Gelbart.
W. H. Freeman and Company, New York (1999)
Chapter 26, Evolutionary Genetics, Origin of new genes, Table 26-5, side 788
ISBN 0-7167-3520-2
www.whfreeman.com


Med venlig hilsen,
Mogens Kall, The servant of Michael
--
SETI: Win (vind) 3500 Danish Kr. (around 600 US $), jump ...
3493 news:UIMxd.76610$Vf.3624746@news000.worldonline.dk
(use perhaps http://www.google.dk/grphp )
File-number: 3600



Jacob Andersen (24-01-2005)
Kommentar
Fra : Jacob Andersen


Dato : 24-01-05 13:47

"Jesus-loves-you" <John15.13@Heaven> skrev i en meddelelse
news:gZcId.84522$Vf.3754830@news000.worldonline.dk...
> Jeg har nu midlertidigt anskaffet mig bogen, både version 7 og 8, for
> øvrigt en interessant lærebog ...

Jeg er imponeret af din indsats. Og glad for, at du har taget mit indlæg til
dig! :) Men det er, ganske rigtigt, en fremragende lærebog.

> Ændringerne er mere omfattende end du har beskrevet. Disse er følgende:
>
> AUU ændret fra isoleucin til methionin
> AUA ændret fra isoleucin til methionin
> AUG ændret fra methionin til isoleucin
> UGA ændret fra STOP til tryptophan
> AGA ændret fra arginin til STOP
> AGG ændret fra arginin til STOP
>
> Er dette forstået (af mig) korrekt ?
> (skemaet kan give anledning til misforståelser, hvilket *IKKE* gør bogen
> 100% pålidelig)

De ændringer jeg beskrev var, så vidt jeg kan se, generelle for alle
eukaryoter. De ændringer du her refererer, gør sig udelukkende gældende for
menneskelige mitochondrier.
Jeg vil forøvrigt give dig ret i, at dette skema ikke er helt heldigt
konstrueret (specielt når det sammenlignes med skema 10-27 på s. 318,
hvilket det jo faktisk skal), men mener også, at du har forstået det
korrekt.

> Dét, der nu bliver det interessante, er at undersøge, om dette i *praktis*
> har nogen betydning:
>
> 1.
> Om metochondriernes vital-funktioner er præget af ændringen ?

Tja, de synes i hvert fald at fungere. Forøvrigt er mitochondrierne
efterhånden blevet så integrerede dele af vores celle-organeller, at mange
af deres proteiner bliver kodet i cellekernen, og blot har signalsekvenser,
der fører dem til mitochondrierne efter de er blevet translaterede. Men jeg
ved ikke nok om emnet til at besvare dit spørgsmål i detaljer.

> 2.
> Om *alle* eukaryoters mitochondrie-genkode er af denne varianttype ?

Nej, det er de ikke. Der findes forskellige typer mitochondrier-varianter i
forskellige organismer. (jvf. Griffiths et al., side 327)

> Mht. ...
>> Den sidste afvigelse (UGA-> tryptophan istedet for stop) gør sig
>> forøvrigt
>> også gældende for gærceller. Andre afvigelser fra den universelle kode
>> kan
>> ses i genomet for visse protozoer*.
>
> ... kan jeg IKKE úmiddelbart finde det sted, du henviser til, idet jeg
> desværre ikke er så god til engelsk, så ...
>
> Kunne du oplyse mig om sidetallet ?

Naturligvis. Det står også på side 327 (i 7. udgave). Det er forøvrigt nu
ikke væsentligt mere uddybende end min reference, da der ordret står "Other
exceptions to the universal code are found in the nuclear genome of some
protozoans." Så man skal vist ud i mere specialiseret litteratur (eller
tidsskrifter) for at få dén forklaret.

Jeg mener forøvrigt stadig ikke, der er noget i det ovenstående, der er
uforeneligt med darwinistisk evolutionsteori.

Mvh.
Jacob Andersen



Jesus-loves-you (30-01-2005)
Kommentar
Fra : Jesus-loves-you


Dato : 30-01-05 11:24

"Jacob Andersen" skrev
news:41f4ee4a$0$48316$14726298@news.sunsite.dk

[ ... ]
> > Ændringerne er mere omfattende end du har beskrevet. Disse er følgende:
> >
> > AUU ændret fra isoleucin til methionin
> > AUA ændret fra isoleucin til methionin
> > AUG ændret fra methionin til isoleucin
> > UGA ændret fra STOP til tryptophan
> > AGA ændret fra arginin til STOP
> > AGG ændret fra arginin til STOP
> >
> > Er dette forstået (af mig) korrekt ?
> > (skemaet kan give anledning til misforståelser, hvilket *IKKE* gør bogen
> > 100% pålidelig)
>
> De ændringer jeg beskrev var, så vidt jeg kan se, generelle for alle
> eukaryoter. De ændringer du her refererer, gør sig udelukkende gældende
> for menneskelige mitochondrier.
> Jeg vil forøvrigt give dig ret i, at dette skema ikke er helt heldigt
> konstrueret (specielt når det sammenlignes med skema 10-27 på s. 318,
> hvilket det jo faktisk skal), men mener også, at du har forstået det
> korrekt.
>
> > Dét, der nu bliver det interessante, er at undersøge, om dette i
> > *praktis* har nogen betydning:
> >
> > 1.
> > Om metochondriernes vital-funktioner er præget af ændringen ?
>
> Tja, de synes i hvert fald at fungere. Forøvrigt er mitochondrierne
> efterhånden blevet så integrerede dele af vores celle-organeller, at mange
> af deres proteiner bliver kodet i cellekernen, og blot har
> signalsekvenser,
> der fører dem til mitochondrierne efter de er blevet translaterede. Men
> jeg ved ikke nok om emnet til at besvare dit spørgsmål i detaljer.
>
> > 2.
> > Om *alle* eukaryoters mitochondrie-genkode er af denne varianttype ?
>
> Nej, det er de ikke. Der findes forskellige typer mitochondrier-varianter
> i forskellige organismer. (jvf. Griffiths et al., side 327)
>
> > Mht. ...
> >> Den sidste afvigelse (UGA-> tryptophan istedet for stop) gør sig
> >> forøvrigt
> >> også gældende for gærceller. Andre afvigelser fra den universelle kode
> >> kan
> >> ses i genomet for visse protozoer*.
> >
> > ... kan jeg IKKE úmiddelbart finde det sted, du henviser til, idet jeg
> > desværre ikke er så god til engelsk, så ...
> >
> > Kunne du oplyse mig om sidetallet ?
>
> Naturligvis. Det står også på side 327 (i 7. udgave). Det er forøvrigt nu
> ikke væsentligt mere uddybende end min reference, da der ordret står
> "Other
> exceptions to the universal code are found in the nuclear genome of some
> protozoans." Så man skal vist ud i mere specialiseret litteratur (eller
> tidsskrifter) for at få dén forklaret.
>
> Jeg mener forøvrigt stadig ikke, der er noget i det ovenstående, der er
> uforeneligt med darwinistisk evolutionsteori.


Næ, umiddelbart ikke, og dog ...

Det undrer mig temmelig meget, som jeg skrev i min egen opfølgning, at
varianterne ...

3590 news:rbQId.84864$Vf.3759555@news000.worldonline.dk
>
> ... de har ligesom "arven" noget fra hinanden *efter* differentieringen,
> og det er jo i grunden ret úlogisk.
>
> Det er ret usandsynligt, at en ændring ændres *tilbage* til
> udgangspunktet igen.
>
> Og det er også ret usandsynligt, at alle eventuelle mellemled skulle være
> uddøde.

Noget kunne godt tyde på, at det er i disse år, at forskningsresultaterne
fremkommer, idet der er en væsentlig udvidelse på dette område fra 7'ende
(1999) til 8'ende (2005) udgave.

Måske er de efterspurgte mellemled slet ikke uddøde men blot endnu ikke
blevet opdaget.

Det ku' være sjovt at se, hvad seneste nyt er ...

Så det er nok for tidligt at komme med en endelig konklusion, men et ganske
interessant forskningsfelt ...

-

Et (for mig at se) vigtigt spørgsmål melder sig:

Findes der *gentagelser* af "DNA-opskriften" på t-RNA-molekylerne (i
mitochondrierne og andre steder) ?

Evolutionsmæssig set kunne sådanne gentagelser være en fordel for en
organisme, idet der så kunne rådes bod på en eventuel defekt på dette vitale
område (a la en art ekstra reservehjul).

Dette bevirker dog så også samtidig, at der i praksis kan åbnes op for
genetiske kode-varianter uden de dertil knyttede komplikationer mht.
stofskifteprocessen.

Cellen vil fortsat være i stand til at produksere de fornødne proteiner vha.
det "gamle" kodesystem samtidig med, at en eventuel mutation specifikt på
t-RNA-opskriften (kopiet) muliggør produktion af nye stoffer vha. det nye
kodesystem. En masse irrelevante stoffer vil dog samtidig blive produkseret.


For øvrigt - tak for dit indlæg, Jacob ...


Med venlig hilsen
Mogens Kall, The servant of Michael
--
SETI: Win (vind) 3500 Danish Kr. (around 600 US $), jump ...
3493 news:UIMxd.76610$Vf.3624746@news000.worldonline.dk
(use perhaps http://www.google.dk/grphp )
File-number: 3596



Søg
Reklame
Statistik
Spørgsmål : 177552
Tips : 31968
Nyheder : 719565
Indlæg : 6408847
Brugere : 218887

Månedens bedste
Årets bedste
Sidste års bedste