|  | 		    
					
        
         
          
         
	
          | |  | Empirisk formel, største enkeltmolekyle? Fra : Herluf Holdt, 3140
 | 
 Dato :  26-03-02 12:44
 | 
 |  | I gamle dage (for 30 år siden) så jeg (i Abrahamsen/Pedersen: Biologi for 3.
 real ca. 1964, 1. udgave) en empirisk formel på hæmoglobin, der fik de 3 små
 grå til at rotere:
 C2952 H4664 O812 N832 S18 Fe4
 Der var også en endnu større formel på myoglobin, som blev fjernet i 2.
 udgaven af bogen (den har nok været tvivlsom).
 De følgende 30 år har jeg ikke kunnet finde store empiriske formler nogen
 steder. I dag bruges desværre mest konstitutionsformler. Ved
 røntgenkrystallografi har man åbenbart (iflg. SDE) efter 1949 fundet frem
 til hæmoglobinets molekylstruktur. Var det den gang man fandt de store
 empiriske formler?
 Nu spørger jeg som den nysgerrige amatør: Er der fundet større
 enkeltmolekyler? (de endeløse kædemolekyler interesserer mig ikke). Den
 største empiriske formel på et mineral fra geologiens verden, jeg har set på
 tryk er hornblende: (Ca,Na,K)2½(Mg,Fe,Al)5(Si,Al)8 O22(OH)2
 Er der nogen større?
 Mvh. Herluf Holdt.
 
 
 
 
 
 |  |  | 
  Claus Rasmussen (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Claus Rasmussen
 | 
 Dato :  26-03-02 13:08
 | 
 |  | Herluf Holdt, 3140 wrote:
 
 > Nu spørger jeg som den nysgerrige amatør: ....................
 
 Det gør jeg også: Hvad er "empiriske formler", og hvad er "konstitutions
 formler" ?
 
 -Claus
 
 
 
 |  |  | 
  Herluf Holdt, 3140 (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Herluf Holdt, 3140
 | 
 Dato :  26-03-02 17:32
 | 
 |  | Afspor nu venligst ikke "tråden".
 Empirisk formel fremgår ret tydeligt af eksemplerne mit indlæg. Det er det
 du hører hver dag, når der siges CO2-forurening, H2O,  o.s.v.
 Altså grundstoffernes bogstaver, forsynet med små tal forneden, som angiver
 antallet af atomer. (Kan desværre ikke gengives i "e-mail-typografi" af
 mig).
 Konstitutionsformel for f.eks. CO2
 er det, at man skriver et stort C, og tegner to streger ud fra dette til
 hvert sit O.
 Mvh. Herluf  Holdt.
 
 
 
 
 
 
 |  |  | 
   Claus Rasmussen (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Claus Rasmussen
 | 
 Dato :  26-03-02 17:44
 | 
 |  | Herluf Holdt, 3140 wrote:
 
 > Afspor nu venligst ikke "tråden".
 
 Det var skam oprigtigt ment. Jeg havde aldrig hørt begreberne brugt
 før.
 
 Men tak for svaret. Så forstod jeg det.
 
 -Claus
 
 
 
 |  |  | 
   Claus Rasmussen (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Claus Rasmussen
 | 
 Dato :  26-03-02 17:54
 | 
 |  | 
 "Herluf Holdt, 3140" <herluf@worldonline.dk> skrev i en meddelelse
 news:Yu1o8.2174$iY5.43493@news010.worldonline.dk...
 > Afspor nu venligst ikke "tråden".
 > Empirisk formel fremgår ret tydeligt af eksemplerne mit indlæg. Det er det
 > du hører hver dag, når der siges CO2-forurening, H2O,  o.s.v.
 > Altså grundstoffernes bogstaver, forsynet med små tal forneden, som
 angiver
 > antallet af atomer. (Kan desværre ikke gengives i "e-mail-typografi" af
 > mig).
 
 Er det nu også korrekt? Så vidt jeg er orienteret beskriver den empiriske
 formel forholdet mellem grundstofferne i kemikaliet. Eksempelvis vil den
 empiriske formel for glucose være CH2O i modsætning til strukturformlen
 C6H12O6.
 
 /Claus
 
 
 
 
 |  |  | 
   Regnar Simonsen (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Regnar Simonsen
 | 
 Dato :  26-03-02 18:12
 | 
 |  | Herluf  Holdt skrev :
 > Afspor nu venligst ikke "tråden".
 > Empirisk formel fremgår ret tydeligt af eksemplerne mit indlæg. Det er det
 > du hører hver dag, når der siges CO2-forurening, H2O,  o.s.v.
 > Altså grundstoffernes bogstaver, forsynet med små tal forneden, som
 angiver
 > antallet af atomer. (Kan desværre ikke gengives i "e-mail-typografi" af
 > mig).
 > Konstitutionsformel for f.eks. CO2
 > er det, at man skriver et stort C, og tegner to streger ud fra dette til
 > hvert sit O.
 
 Jeg er ikke enig i din definition af formler .
 
 En empirisk formel - også kaldet den støkiometriske formel angiver forholdet
 mellem antallet af atomer.
 F.eks. er den empiriske formel for hexen : CH2
 
 Molekylformler angiver antallet af atomer - for hexen : C6H12
 
 Strukturformler (eller konstitutionsformler) angiver hvilke atomer, der er
 bundet sammen. Disse kan skrives mere komprimerede som "kondenserede
 strukturformler" - f.eks. ethanol :  CH3CH2OH
 
 Konfigurationsformler angiver atomernes rumlige placering - anvendes f.eks.
 i stereoisomeri (hvor man ved en Fischerprojektion kan aftegne formlen i 2
 dimensioner)
 
 Det du spørger efter er altså store molekylformler
 
 
 Hilsen
 Regnar Simonsen
 
 
 
 
 
 |  |  | 
   Morten Bjergstrøm (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Morten Bjergstrøm
 | 
 Dato :  26-03-02 19:42
 | 
 |  | 
 
            "Herluf Holdt, 3140" <herluf@worldonline.dk> skrev:
 > Empirisk formel fremgår ret tydeligt af eksemplerne mit indlæg.
 Nej. Det du har angivet i dit indlæg er en bruttoformel.
 > Det er det du hører hver dag, når der siges CO2-forurening, H2O, 
 > o.s.v. Altså grundstoffernes bogstaver, forsynet med små tal
 > forneden, som angiver antallet af atomer.
 Nej. En empirisk formel er en formelenhed, der skal ganges med en 
 konstant for at få molekyleformlen
 > Konstitutionsformel for f.eks. CO2
 > er det, at man skriver et stort C, og tegner to streger ud fra
 > dette til hvert sit O.
 Korrekt.
 -- 
 Mvh. Morten                       http://miljokemi.dk Miljøtemaer:                 http://tema.miljokemi.dk Miljøkemisk Forum:          http://forum.miljokemi.dk |  |  | 
  Thomas Doktor (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Thomas Doktor
 | 
 Dato :  26-03-02 17:30
 | 
 |  | 
 "Herluf Holdt, 3140" <herluf@worldonline.dk> wrote in message
 news:OiZn8.1802$iY5.32444@news010.worldonline.dk...
 > I gamle dage (for 30 år siden) så jeg (i Abrahamsen/Pedersen: Biologi for
 3.
 > real ca. 1964, 1. udgave) en empirisk formel på hæmoglobin, der fik de 3
 små
 > grå til at rotere:
 > C2952 H4664 O812 N832 S18 Fe4
 > Der var også en endnu større formel på myoglobin, som blev fjernet i 2.
 > udgaven af bogen (den har nok været tvivlsom).
 
 Det er nok ikke så mærkeligt. Hæmoglobin er sådan rundt regnet 4 gange
 større end myoglobin!
 
 Nu siger du, at du ikke er interesseret i endeløse kæder, men når du er på
 udkig efter rigtig store molekyler kommer du ikke rigtig udenom dem.
 Hæmoglobin er en polymer af aminosyrerester og som sådan blot en "endeløs"
 kæde.
 De største molekyler er selvfølgelig carbon-forbindelser såsom diamant og
 enkelte grafit-lag.
 I biologien vil jeg skyde på det største molekyle vi kender er en af DNA
 strengene i det menneskelige kromosom 21q (igen en "endeløs" kæde). Jeg
 kender ikke den empiriske formel, men der er 33,827,477 basepar i dette
 kromosom (25,491,867 sammenhængende) og det er jo en del. Antager vi at
 baseparrene er ligelidt fordelt, bliver vægten på den ene sammenhængende
 streng 25,491,867 * 305.19625 Da = 7.8 GDa, hvor hæmoglobin vejer ca. 66 kDa
 og altså kun ca. 1/120000 del af kromosom 21q. Tallene skal selvfølgelig
 tages med et vist forbehold, men de giver dog et indtryk at molekylets
 størrelse.
 
 Her er et link til en side med nogle mineraler med lange empiriske formler.
 Du skal dog huske at mineraler ikke er molekyler. Den empiriske formel for
 mineraler skal ikke ses som et udtryk for hvad et "molekyle" af mineralet
 består af men derimod et blandingsforhold. Tag f.eks. NaCl. Salt danner
 store sammenhængende krystaller (ligesom diamant) men blandes 1:1. Du kan
 altså ikke finde verdens største molekyle i mineralernes verden da de
 simpelthen ikke er molekyler da deres bindinger er mere eller mindre ioniske
 (diamant er et molekyle fordi bindingerne er kovalente).
 
 Mvh
 Thomas
 
 
 
 
 |  |  | 
  Thomas Doktor (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Thomas Doktor
 | 
 Dato :  26-03-02 17:44
 | 
 |  |  |  |  | 
  Herluf Holdt, 3140 (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Herluf Holdt, 3140
 | 
 Dato :  26-03-02 19:10
 | 
 |  | "Thomas Doktor"  skrev:
 >  Nu siger du, at du ikke er interesseret i endeløse kæder, men når du er
 på
 > udkig efter rigtig store molekyler kommer du ikke rigtig udenom dem.
 > Hæmoglobin er en polymer af aminosyrerester og som sådan blot en "endeløs"
 > kæde.
 
 Tak for dit svar, som jeg føler mig meget mere oplyst af.
 
 Mht. hæmoglobins "endeløshed" er jeg stadig noget skeptisk. I bogen
 "Biokemi" (DVF,1971) er dette molekyle gengivet som en plasticmodel (af
 Perutz). Et afsluttet, kugle/ellipseformet legeme, bestående af fire
 enheder, ens to og to, hvor kæderne samles omkring "jernporphyriner".
 Som den "nysgerrige amatør", burde jeg måske slet ikke kigge i sådanne
 bøger, men jeg er altså stærkt fascineret af disse "afsluttede,
 fritsvømmende store molekyler".
 
 (Men nu kom andre med nye benævnelser af definitionerne til  - og det hele
 blev endnu mere kompliceret.)
 Mvh. Herluf Holdt.
 
 
 
 
 
 |  |  | 
   Thomas Doktor (26-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Thomas Doktor
 | 
 Dato :  26-03-02 20:10
 | 
 |  | 
 "Herluf Holdt, 3140" <herluf@worldonline.dk> wrote in message
 news:9W2o8.2201$iY5.47751@news010.worldonline.dk...
 > "Thomas Doktor"  skrev:
 > >  Nu siger du, at du ikke er interesseret i endeløse kæder, men når du er
 > på
 > > udkig efter rigtig store molekyler kommer du ikke rigtig udenom dem.
 > > Hæmoglobin er en polymer af aminosyrerester og som sådan blot en
 "endeløs"
 > > kæde.
 >
 > Tak for dit svar, som jeg føler mig meget mere oplyst af.
 >
 > Mht. hæmoglobins "endeløshed" er jeg stadig noget skeptisk. I bogen
 > "Biokemi" (DVF,1971) er dette molekyle gengivet som en plasticmodel (af
 > Perutz). Et afsluttet, kugle/ellipseformet legeme, bestående af fire
 > enheder, ens to og to, hvor kæderne samles omkring "jernporphyriner".
 > Som den "nysgerrige amatør", burde jeg måske slet ikke kigge i sådanne
 > bøger, men jeg er altså stærkt fascineret af disse "afsluttede,
 > fritsvømmende store molekyler".
 >
 > (Men nu kom andre med nye benævnelser af definitionerne til  - og det hele
 > blev endnu mere kompliceret.)
 > Mvh. Herluf Holdt.
 >
 >
 Det er rigtigt at konformationen af  hæmoglobin er et kugle/ellipseformet
 molekyle. Dette skyldes at proteinet "folder op". Du kan forstille dig en
 lille sytråd som du nulrer sammen til en kugle. Så selvom den endelige form
 af hæmoglobin ikke er en lang kæde så er proteinet i bund og grund en
 samling af fire lange kæder + 4 hæm-grupper.
 De fire subunits minder hver især meget om myoglobin, deraf kommer at
 hæmoglobin er ca. 4 gange større end myoglobin.
 Her er et billede af hemoglobin:
http://omlc.ogi.edu/spectra/hemoglobin/hemostruct/ Mvh
 Thomas
            
             |  |  | 
    Herluf Holdt, 3140 (28-03-2002) 
 
	
          | |  | Kommentar Fra : Herluf Holdt, 3140
 | 
 Dato :  28-03-02 08:48
 | 
 |  | Endnu en tak til "trådens" bidragydere.
 Jeg lærte at man skal spørge rigtigt.
 Og lærte nogle flere definitioner på molekyler.
 Og jeg fik et par gode links. Thomas gav mig et godt link om hæmoglobin.
 Vil bare lige tilføje at når jeg sagde at jeg ikke "var interesseret i
 endeløse kæder", var det bare for at slippe for alle de der kedelige
 eksempler på plastic-møbler, som er et stort molekyle, eller nylonsnøre, som
 man selv må klippe af.
 Men jeg fik da ikke en større formel ud af det end den på hæmoglobin.
 Det skulle måske have været DNA.
 DNA er jo heller ikke "helt endeløst" ligesom en "klip-selv-af-nylonfiber".
 Selvfølgelig er DNA nok et af de mest spændende store molekyler mennesket
 kan interessere sig for.
 Det vil jeg så som den nysgerrige amatør fortsætte med.
 
 Med venlig hilsen
 Herluf Holdt, DK-3140
 --
 Mit første ønske (ud af af mine ni sidste)
 er at klø en nordisk los under hagen
 og høre den spinde.
 
 
 
 
 
 |  |  | 
 |  |